1996年，参加了新星选拔赛并赢得冠军。

1997年，拍摄第一部的日剧，是由友坂理惠主演的《FIVE》。

1998年，恭子的事业开始起步，先是参加了电视剧《新闻女郎》的拍摄，在剧中扮演敢于示爱的女学生。7月7日，与金城武主演的电视剧《神啊，请多给我一点时间》在日本上播，饰演一位艾滋病少女。

1999年1月12日，深田恭子与陈慧琳主演的电视剧《鬼之栖家》在日本上映，饰演加藤亚由美。6月10日，参与拍摄的电影《午夜凶铃2》在中国香港上映。7月2日，与堂本刚、原沙知绘、赤井英和主演的电视剧《暗恋》在日本首播，饰演三浦透子。

2000年1月11日，与黑木瞳主演的电视剧《爱情梦幻》在日本首播，饰演饭岛有羽。7月1日，与草剪刚主演的电视剧《冠军大胃王》在日本首播，饰演田村麻奈美。12月29日，参与拍摄的电视迷你剧集《离天国最近的男人 特别版》在日本首播。

2001年1月12日，与泷泽秀明主演电视剧《蛋糕上的草莓》在日本首播，饰演三泽唯。4月5日，主演的电视系列剧《世界奇妙物语2001春季特别篇》在日本首播，饰演交友登记。7月4日，与尹孙河、坂口宪二、天海佑希主演的电视剧《斗阵美眉》在日本首播，饰演吉田小夜子。

2002年，深田恭子参与拍摄富士电视台制作的，由市川昆执导系列剧《黑十人之女》。2月4日，与元斌主演的电视迷你剧《命运之恋》在日本首播，饰演浅井智子。4月17日，与渡部笃郎、池内博之、和久井映见主演的电视剧《初恋》在日本首播，饰演江泽夏澄。10月12日，与堂本光一、玉木宏、大仓孝二主演的电视剧《遥控刑警》在日本首播；同时深田恭子参与拍摄的电影《玩偶》在同一天上映。

2003年8月23日，与长濑智也主演的电影《两个人》在日本上映。10月4日，与野村万斋、伊藤英明主演的电影《阴阳师2》在日本上映，饰演Himiko。10月7日，与饭岛直子主演的电视剧《二人姐妹》在日本首播，饰演古森灯。11月8日，与大竹忍、黑木瞳、深津绘里主演的电影《宛如阿修罗》在日本上映。

2004年1月17日，与长濑智也主演的电视剧《她已不在人间》在日本首播。5月13日，与土屋安娜、阿部隆史、小池荣子主演的电影《下妻物语》在法国上映。7月8日，与二宫和也、田边诚一主演的电视剧《阿南的小情人》在日本首播。

2005年，凭借在《下妻物语》中的出色表现，荣获第59届每日电影最佳女主角奖、第26届横滨电影节最佳女主角奖和第28届“日本奥斯卡”优秀女演员赏。1月13日，与夏八木勋主演的电视剧《富豪刑事》在日本首播，饰演神户美和子。7月14日，与松下由树、谷原章介、鹤见辰吾主演的电视剧《想要幸福》在日本首播，饰演浅田光。

2006年1月2日，与永濑正敏、泉谷茂主演的电影《天使》在日本上映。4月，主演的电视剧《富豪刑事2》在日本首播，饰演神戸美和子。12月16日，参与拍摄的电影《犬神家族》在日本上映，饰演阿春。

2007年7月5日，与伊东美咲主演的电视剧《峰女与壁女》在日本首播，饰演毬谷真理恵。9月9日，与松本幸四郎主演的电视迷你剧《留芳颂》在日本首播，饰演小田切早知。10月15日，参与拍摄的电视剧《神探伽利略》在日本首播，在第七集中饰演静子。

2008年1月，主演朝日电视的《未来老师》，饰演一个名可以预测未来的补习班英语老师。9月宣布加入NHK大河剧《天地人》饰演丰臣秀吉的妾侍淀君。11月1日，深田恭子发行了写真集《25岁》。

2009年1月4日，参与拍摄的电视剧《天地人》在日本首播，饰演阿淀。3月7日，与樱井翔、福田沙纪主演的电影《小双侠》上映，饰演多龙芝。3月22日，发行写真《KYOKO TOKYO PIN-UP GIRL》。7月18日，与长濑智也主演的电视剧《华丽间谍》在日本首播，饰演Dorothy。12月19日，与船越英一郎、滨口优、桑代贵明主演的电影《乌鲁鲁的森林物语》在日本上映，饰演生野千惠。

2010年1月12日，与佐藤隆太主演的电视剧《率直男人》在日本首播。9月25日，与椎名桔平、冢本高史、中村雅俊主演的电影《恋爱戏曲：请与我恋爱吧》在日本上映，饰演谷山真由美。10月12日，主演的电视剧《第二处女》在日本首播。10月21日，主演的电视剧《幻夜》在日本首播。

2011年4月29日，参与配音的动画《豆富小僧》在日本上映。8月6日，与香取慎吾、香里奈、伊武雅刀主演的电影《乌龙派出所电影版：封锁胜哄桥》在日本上映，饰演桃子小姐。9月23日，与铃木京香、长谷川博己主演的电影《第二处女》在日本上映。10月8日，与岸谷五朗、木村多江、石黑贤主演的电影《拂晓之街》在日本上映。10月21日，与藤木直人邓主演的电视剧《专业主妇侦探》在日本首播。10月29日，参与拍摄的电影《了不起的亡灵》在日本上映。12月21日，参与拍摄的电影《野性之七人》在日本上映。

2012年1月，与松山健一、冈田将生、玉木宏主演的电视剧《平清盛》在日本首播。

2013年11月9日，与北川景子、高良健吾、田口智朗等主演的恐怖电影《室友》在日本上映。

2014年3月8日，与滨田岳、冈田将生主演、水落丰执导的电影《伟大的咻啦啦砰》在日本上映。4月8日，主演的电视剧《Silent Poor》在日本首播；同年参与拍摄电影《JOKER GAME》。